碳源的補充，在很多污水廠的進水中，總氮偏高，碳氮比遠遠低于理論計算中的5：1的生物脫氮的基本數據，需要外加碳源來滿足。從理論的說法上，最佳的碳源是乙酸鈉，但是在實際的調試中，發現乙酸鈉的質量問題成為影響生物脫氮的重要因素。乙酸鈉在污水廠的采購中副產品居多，對于許多污水廠來說其質量無法有效監控和化驗，導致乙酸鈉質量良莠不齊，往往在穩定投加運行期間，突然就發現出水的總氮又出現超標了，分析各種原因很難判斷，反復嘗試后，最終確定是在碳源的選擇上，更換了其他供應商的乙酸鈉，生物脫氮效果就明顯恢復。由于國內復產乙酸鈉廠家眾多，污水廠在采購藥劑時不具備藥劑純度的鑒別能力，經常受到藥劑質量變化的干擾。為了避免出現這種情況，建議一定選擇國標原料生產的乙酸鈉，且有正規生產資質的乙酸鈉生產廠家，這樣對于污水廠來說，就不需有質量上的擔憂，只需認真考慮碳源投加的量和地點即可。

碳源的投加，在一些污水廠運行中是很大的成本支出，為了降低成本，要靈活利用進水的碳源，把進水采取一定的手段配置到反硝化區域，利用進水中的BOD作為碳源，可以適當減少加藥量，有效的降低運行成本。這個工作，污水廠可以在廠內進行詳細的調研，充分發揮廠內的設施設備優勢，進行脫氮的碳源的補充。