無論是單張紙還是卷筒紙印刷方式，如果配備了平壓平模切，其后加工在工藝性上就會存在一些缺陷。因此，模切工藝的選擇成為紙盒加工中第二重要的決定因素。
盡管現在圓壓圓模切模具的價格仍比平壓平模切模具高，但圓壓圓模切模具價格的逐步降低及其可靠性的逐步提高，使其普及范圍不斷擴大。到目前為止，越來越多的紙盒加工商已經認識到圓壓圓模切加工方式的優越性，主要體現在對較高的平均加工速度、加工工藝的相似一致性(輪轉印刷+圓壓圓模切)、較低的投資及簡單、快捷的準備的認可上。
從表1很容易看出圓壓圓模切方式的成本優勢。在設備投資方面，一臺平壓平模切機的價格足以購買多臺圓壓圓模切機。盡管圓壓圓模切版的價格稍高，但其投資是可以推遲的，只有在實際接到特殊紙盒加工訂單時，才需要購買模具。再進一步講，現代圓壓圓模切版已被制造得非常精確，以至于絕大部分印前準備工作都在模具加工廠里完成，模切版的墊版、挖空、貼壓痕墊條等準備工作在印刷企業都已不復存在，印刷企業只需用一片薄薄的雙面膠進行粘版就足夠了，實際上也降低了成本。
當然，所有因素中最重要的仍然是生產效率。與聯動平壓平模切加工工藝相比，圓壓圓模切加工的生產效率要高得多。在成功采用了減少裁切空白等新方法后，紙盒加工生產的成功要素就是單位時間內的加工數量，即如何提高生產效率。平壓平模切與卷筒紙印刷工藝的組合雖然也具有較高的加工速度，但較高的設備維護費、模切排廢的困難和套準的難度，使得實際加工生產能力比不上圓壓圓模切加工。
當然，圓壓圓模切也不是萬能的。大幅面印刷的小紙盒加工生產采用平壓平模切工藝仍然具有優勢，在某些方面甚至超過窄幅輪轉+圓壓圓模切工藝的加工能力。
需要注意的是，圓壓圓模切加工設備的類型眾多，需要具有相當豐富的知識才能做出成功的選擇。